Accuracy of nanopore-based targeted next-generation sequencing assay for detection of Mycobacterium tuberculosis and drug resistance from non-sputum specimens: a multicenter prospective study in China

Туберкулез (ТБ) остается ведущей причиной смертности, вызванной одиночным инфекционным агентом. Целевое секвенирование нового поколения (tNGS) стало перспективным молекулярным методом диагностики ТБ, однако его точность и применение для образцов, не содержащих мокроту, до сих пор остаются неизученными. В это многоцентровое проспективное лабораторное исследование были привлечены 701 человек из пяти туберкулезных больниц, выбранных в разных провинциях Китая. Образцы, не содержащие мокроту, были собраны для проведения tNGS, Xpert Mycobacterium tuberculosis (MTB)/RIF (Xpert) и культуральных исследований. Диагностическая точность tNGS для пациентов с ТБ оценивалась в сравнении с микробиологическим эталонным стандартом (MRS).

Фенотипические тесты на чувствительность к лекарственным препаратам (ТЛЧ) проводились с использованием изолятов, положительных по культуре, и применялись для оценки точности tNGS в выявлении лекарственной устойчивости. Авторы обнаружили, что анализ tNGS продемонстрировал высокую диагностическую точность с чувствительностью и специфичностью 93,4% (95% ДИ, 91,5%-95,2%) и 93,2% (95% ДИ, 91,3%-95,0%) при использовании MRS в качестве золотого стандарта. Диагностическая эффективность tNGS была надежной независимо от типов образцов и клинических симптомов. tNGS также показал потенциал обнаружения других сопутствующих респираторных патогенов.

У более чем 90% лиц с положительным результатом tNGS были получены результаты определения чувствительности к лекарственным препаратам, которые в основном зависели от бактериальной нагрузки. По сравнению с фенотипическими ТЛЧ, tNGS обладал высокой чувствительностью и специфичностью для выявления устойчивости к рифампицину, изониазиду, стрептомицину, этамбутолу и левофлоксацину. Результаты показали, что анализ tNGS является быстрым и высокочувствительным тестом для диагностики туберкулеза и одновременного выявления лекарственной устойчивости в образцах, не являющихся мокротой. Его точность выигрывает по сравнению с традиционными методами и наиболее значительна у больных туберкулезом с низкой бактериальной нагрузкой.

ВАЖНОСТЬ
Диагностика туберкулеза (ТБ) по-прежнему остается сложной задачей, особенно у пациентов без выделения мокроты. Целевое секвенирование следующего поколения на основе нанопор (tNGS) является перспективной технологией для выявления случаев ТБ и лекарственной устойчивости, способной предоставлять панель профилей лекарственной устойчивости. Цель данного исследования — изучить диагностическую эффективность tNGS для образцов без мокроты из пяти туберкулезных больниц, выбранных в разных регионах Китая. По сравнению с микробиологическим эталонным стандартом (MRS), tNGS продемонстрировал высокую чувствительность и специфичность, которые связаны с бактериальной нагрузкой в образцах. Кроме того, tNGS способен выявлять сопутствующие респираторные патогены и создавать профили лекарственной устойчивости. Таким образом, результаты исследования показали, что tNGS является альтернативным методом диагностики пациентов с туберкулезом, не выделяющих мокроту.

Неофициальный перевод: АНО «Здоровье.ру» 2026.

Смотреть полный текст статьи в оригинале на сайте публикатора (на англ. языке).

Полные данные (заголовок, авторы, дата и источник публикации):