Краткое содержание статьи. Неофициальный перевод на русский язык:
«Скрининг и целенаправленное секвенирование образцов стула для микробиологического подтверждения и определения лекарственной устойчивости при олигобациллярном туберкулезе»
КРАТКОЕ СОДЕРЖАНИЕ:
В 2023 году, по различным оценкам, число заболевших туберкулезом составило 10,8 миллиона человек, и 1,25 миллиона человек умерли от этого заболевания. При этом 161 000 смертей зарегистрировано среди людей с ВИЧ (ЛЖВ) — для этой группы населения туберкулез остается основной причиной смерти. Выявление лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis остается сложной задачей среди пациентов с олигобациллярным туберкулезом; поскольку бактериальная нагрузка в их мокроте настолько низка, что ее невозможно обнаружить с помощью микроскопии; бактерий недостаточно и для других анализов мокроты, которые могли бы обеспечить тестирование на резистентность.
В амбулаторной клинике в Эсватини в период с 2020 по 2023 годы были собраны образцы стула и мокроты у части детей, подростков и взрослых, которые были включены в исследование по диагностике туберкулеза. В дополнение к стандартным диагностическим тестам, доступным в стране (прямой тест Xpert на мокроту, тест Xpert на стул и фенотипическое тестирование чувствительности к лекарственным препаратам по результатам посева мокроты), образцы стула подвергались экстракции и секвенированию с использованием целевого секвенирования следующего поколения (tNGS) с применением как набора Oxford Nanopore Technologies (ONT) TB Custom Kit (на ONT MinION Mk1b), так и набора Deeplex Myc-TB kit (на Illumina iSeq 100). Из 250 участников с легочным туберкулезом, диагностированным в Эсватини в период данного исследования, у 85 (34%) участников микроскопическое исследование мокроты показало отрицательный результат.
Из числа обследованных у 21/85 (24,7%) участников было обнаружено достаточное количество ДНК M. tuberculosis, выделенной из кала, для проведения tNGS. Целенаправленное секвенирование кала выявило ДНК M. tuberculosis у 14-19% пациентов (n = 12/85-16/85) и предоставило полную картину мутаций, связанных с лекарственной устойчивостью, у 12-14% (n = 10/85-12/85) пациентов с олигобациллярным туберкулезом (с отрицательным результатом мазка). Это расширило возможности выявления лекарственной устойчивости по сравнению с другими методами. Целенаправленное секвенирование кала, даже при применении в отношении пациентов с олигобациллярным заболеванием, может обеспечить подтверждение случая и расширенную информацию о лекарственной устойчивости.
Неофициальный перевод: АНО «Здоровье.ру» 2026.
Смотреть полный текст статьи в оригинале на сайте публикатора (на англ. языке).
Полные данные (заголовок, авторы, дата и источник публикации):
В 2023 году, по различным оценкам, число заболевших туберкулезом составило 10,8 миллиона человек, и 1,25 миллиона человек умерли от этого заболевания. При этом 161 000 смертей зарегистрировано среди людей с ВИЧ (ЛЖВ) — для этой группы населения туберкулез остается основной причиной смерти. Выявление лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis остается сложной задачей среди пациентов с олигобациллярным туберкулезом; поскольку бактериальная нагрузка в их мокроте настолько низка, что ее невозможно обнаружить с помощью микроскопии; бактерий недостаточно и для других анализов мокроты, которые могли бы обеспечить тестирование на резистентность.
В амбулаторной клинике в Эсватини в период с 2020 по 2023 годы были собраны образцы стула и мокроты у части детей, подростков и взрослых, которые были включены в исследование по диагностике туберкулеза. В дополнение к стандартным диагностическим тестам, доступным в стране (прямой тест Xpert на мокроту, тест Xpert на стул и фенотипическое тестирование чувствительности к лекарственным препаратам по результатам посева мокроты), образцы стула подвергались экстракции и секвенированию с использованием целевого секвенирования следующего поколения (tNGS) с применением как набора Oxford Nanopore Technologies (ONT) TB Custom Kit (на ONT MinION Mk1b), так и набора Deeplex Myc-TB kit (на Illumina iSeq 100). Из 250 участников с легочным туберкулезом, диагностированным в Эсватини в период данного исследования, у 85 (34%) участников микроскопическое исследование мокроты показало отрицательный результат.
Из числа обследованных у 21/85 (24,7%) участников было обнаружено достаточное количество ДНК M. tuberculosis, выделенной из кала, для проведения tNGS. Целенаправленное секвенирование кала выявило ДНК M. tuberculosis у 14-19% пациентов (n = 12/85-16/85) и предоставило полную картину мутаций, связанных с лекарственной устойчивостью, у 12-14% (n = 10/85-12/85) пациентов с олигобациллярным туберкулезом (с отрицательным результатом мазка). Это расширило возможности выявления лекарственной устойчивости по сравнению с другими методами. Целенаправленное секвенирование кала, даже при применении в отношении пациентов с олигобациллярным заболеванием, может обеспечить подтверждение случая и расширенную информацию о лекарственной устойчивости.
Неофициальный перевод: АНО «Здоровье.ру» 2026.
Смотреть полный текст статьи в оригинале на сайте публикатора (на англ. языке).
Полные данные (заголовок, авторы, дата и источник публикации):
Screening and targeted sequencing of stool for microbiologic confirmation and drug resistance determination in paucibacillary tuberculosis
Tara E. Ness, Mangaliso Ziyane, Nontobeko Maphalala, Abigail Seeger, Anca Vasiliu, Wethusonke Khumalo, Mdigo Thunzini, Sindisiwe Dlamini, Gugu Maphalala, Clement Gascua, Christoph Lange, Samantha Meyer, Bryce Inman, Viola Dreyer, Christian Utpatel, Tanja Niemann, Andrew DiNardo, Alexander Kay, Stefan Niemann, Anna Mandalakas
Public Library of Science Global Public Health.
2025 Nov 21;5(11):e0005243.
DOI: 10.1371/journal.pgph.0005243
PMCID: PMC12637971
PMID: 41270009